- a -

• agg_dyint() : CV_rExp_tExp , E_coli , EO_rExp_tExp , Molecular_rExp_tExp
• agg_dyn() : CV_rExp_tExp , CV_rIG_tExp , E_coli , EO_rExp_tExp , EO_rIG_tExp , Molecular_rExp_tExp , Molecular_rIG_tExp
• agg_ligand() : E_coli
• aggiornamento() : E_coli
• all_informations() : Funz_C

- c -

• C() : E_coli
• C_iniziale() : E_coli
• change_lambda_par() : CV_rExp_tExp , EO_rExp_tExp
• change_molecular() : Molecular_rExp_tExp
• change_par() : CV_rExp_tExp , CV_rIG_tExp , E_coli , EO_rExp_tExp , EO_rIG_tExp , Molecular_rExp_tExp , Molecular_rIG_tExp
• change_sigma_par() : CV_rIG_tExp , EO_rIG_tExp , Molecular_rIG_tExp
• CV_rExp_tExp() : CV_rExp_tExp
• CV_rExpIG_tExp() : CV_rExpIG_tExp
• CV_rIG_tExp() : CV_rIG_tExp

- d -

• debugFunction() : CV_rExp_tExp , CV_rIG_tExp , E_coli
• deltaW_ec() : E_coli
• dist_iniz_ec() : E_coli

- e -

• E_coli() : E_coli
• EO_rExp_tExp() : EO_rExp_tExp
• EO_rExpIG_tExp() : EO_rExpIG_tExp
• EO_rIG_tExp() : EO_rIG_tExp
• Exp_dist_ec() : E_coli

- f -

• f_lambda() : CV_rExp_tExp , EO_rExp_tExp , ParameterEstimation_CV_rExp_tExp , ParameterEstimation_CV_rIG_tExp
• F_RC_0() : E_coli
• F_RC_1() : E_coli
• F_RC_q() : E_coli
• f_sigma() : CV_rIG_tExp , EO_rIG_tExp , Molecular_rIG_tExp , ParameterEstimation_CV_rIG_tExp
• F_tipo_response_c() : E_coli
• Funz_C() : Funz_C
• Funz_C_Inter() : Funz_C_Inter
• Funz_C_Par() : Funz_C_Par

- g -

• gamma_par_double_ec() : E_coli
• get_coordinate() : Funz_C
• get_coordinate1() : Funz_C
• Get_RC_0() : E_coli
• Get_RC_1() : E_coli
• Get_RC_q() : E_coli
• Get_tipo_response_c() : E_coli
• gnuplot_response() : E_coli
• gnuplot_single() : CV_rExp_tExp , E_coli , EO_rExp_tExp , Molecular_rExp_tExp
• gnuplot_single_film() : E_coli
• gnuplot_single_film_gif() : E_coli
• gnuplotFunC() : Funz_C
• gnuplotFunzInternalDynalmic() : E_coli
• GoodFit() : GoodFit

- i -

• info_stat() : Funz_C , Funz_C_Par
• initial_position_ec() : E_coli

- m -

• Molecular_rExp_tExp() : Molecular_rExp_tExp
• Molecular_rExpIG_tExp() : Molecular_rExpIG_tExp
• Molecular_rIG_tExp() : Molecular_rIG_tExp

- n -

• N_dyn_var() : E_coli
• new_F_C() : Funz_C , Funz_C_Inter , Funz_C_Par
• newtheta_ec() : E_coli

- p -

• ParameterEstimation_CV_rExp_tExp() : ParameterEstimation_CV_rExp_tExp
• ParameterEstimation_CV_rIG_tExp() : ParameterEstimation_CV_rIG_tExp
• ParameterEstimation_E_coli() : ParameterEstimation_E_coli
• preview_F_C() : Funz_C
• print_fc() : Funz_C , Funz_C_Inter
• print_info() : CV_rExp_tExp , CV_rExpIG_tExp , CV_rIG_tExp , E_coli , EO_rExp_tExp , EO_rExpIG_tExp , EO_rIG_tExp , Funz_C , Funz_C_Inter , Funz_C_Par , Molecular_rExp_tExp , ParameterEstimation_CV_rExp_tExp
• produce() : E_coli
• Production_rate() : E_coli

- q -

• Q_tau_stat() : Q_tau_stat

- r -

• rand_normal_ec() : E_coli
• read_info_stat() : Funz_C , Funz_C_Par
• reset() : Q_tau_stat
• reset_barrier() : CV_rExpIG_tExp , CV_rIG_tExp , E_coli , EO_rExpIG_tExp , EO_rIG_tExp , Molecular_rExpIG_tExp , Molecular_rIG_tExp
• reset_barrier_t() : E_coli
• reset_par() : CV_rExp_tExp , CV_rExpIG_tExp , CV_rIG_tExp , E_coli , EO_rExp_tExp , EO_rExpIG_tExp , EO_rIG_tExp , Molecular_rExp_tExp , Molecular_rExpIG_tExp , Molecular_rIG_tExp
• reset_parameter() : Funz_C
• response_function() : E_coli

- s -

• s_F_lambda_r() : E_coli , ParameterEstimation_CV_rExp_tExp , ParameterEstimation_CV_rIG_tExp , ParameterEstimation_E_coli
• s_funz_lambda() : s_lambda
• s_funz_sigma() : s_lambda
• s_lambda() : s_lambda
• save_dyn() : CV_rExp_tExp , E_coli , EO_rExp_tExp , Molecular_rExp_tExp
• save_E_coli() : E_coli
• save_E_coli_initial() : E_coli
• save_run() : E_coli
• save_theta() : E_coli
• save_tumble() : E_coli
• saveIntDyn() : CV_rExp_tExp , CV_rIG_tExp , E_coli , EO_rExp_tExp , EO_rIG_tExp , ParameterEstimation_CV_rExp_tExp , ParameterEstimation_CV_rIG_tExp
• set_GoodnessFit() : E_coli , ParameterEstimation_E_coli
• set_parameter() : Funz_C , Funz_C_Inter , Funz_C_Par
• set_response() : E_coli
• setEngine_ec() : E_coli
• setProductionRate() : E_coli
• setSeed_ec() : E_coli
• start_simulation() : E_coli
• statF_lambda_r() : E_coli
• StatIntensity() : s_lambda
• stationary_dyn() : CV_rExp_tExp , E_coli , EO_rExp_tExp , Molecular_rExp_tExp

- t -

• Tau_t() : E_coli

- u -

• unifRand_ec() : E_coli

- v -

• V() : E_coli
• V_IG() : Q_tau_stat

- w -

• writeScriptgnuplotSingle() : CV_rExp_tExp , E_coli , EO_rExp_tExp , Molecular_rExp_tExp
• writeScriptLunchgnuplotSingle() : E_coli

- x -

• X() : E_coli